ＵＧＮ研究所に保管されている“賢者の石”を狙うファルツハーツの襲撃により、地上と地下に分断されピンチに陥るコウとあやめ。しかもこの事件の裏にはある男の存在が……。絆と裏切りのネオ・アクション第二弾！